朱冉冉¹ , 吉雪花 ^1* , 张中荣¹ , 李慧姬¹ , 张海英¹ , 宋文胜²

1 石河子大学农学院, 特色果蔬生理与种质资源利用兵团重点实验室, 石河子, 832003; 2 新疆红安种业, 石河子, 832003
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 8 篇   
收稿日期: 2019年02月23日    接受日期: 2019年03月02日    发表日期: 2020年05月20日

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香豆酸 -3- 羟化酶(p-coumarate 3-hydroxylase, C3H)与木质素生物合成途径密切相关，是细胞色素 P450 中的一员。本研究利用生物信息学方法，对 29 条辣椒 C3H 蛋白序列进行分析，预测其一级结构理化特性、基序、二级结构和三级结构，并用 MEGA 5.0 在线软件把拟南芥与辣椒的 C3H 蛋白序列进行比对分析，构建系统进化树。结果表明：辣椒的 C3H 蛋白长度介于 152~983 aa，分子量和等电点分别介于 16 926.8~111 899 和 4.600 8~9.370 6 之间。基序预测发现辣椒 C3H 家族的 10 个保守基序中最长的含 50 个氨基酸；α- 螺旋和无规则卷曲是主要的二级结构，三级结构中都含有螺旋 - 转角 - 螺旋结构。进化树分析表明 CA00g62090 与 AT5G26749.1 同源性高，CA09g17320 与 AT3G51120.1 同源性高，推测辣椒的 CA00-g62090 与 CA09g17320 可能较高程度地参与了木质素合成代谢调控。这为下一步研究 C3H 基因功能提供科学数据。
 

辣椒；C3H；转录因子；生物信息学